Кафедра естественнонаучных дисциплин основана в сентябре 2013 года в результате слияния и последующей реорганизации кафедр общей биологии и экологии и кафедры химии.

Кафедра зоологии - первая биологическая кафедра на факультете, создана в 1962 году доцентом Шиняевой В.А. В этот период на кафедре функционировал живой уголок, где жили лиса, барсук, белки, бурундуки, полозы, черепахи, разные виды птиц в вольере. С появлением в 1973 году в качестве зав.кафедрой Люньковой Н.Я. началось активное приобретение оборудования, коллекций и крупных чучел животных, которые впоследствии вошли в учебный зоологический музей кафедры, который был организован и открыт в январе 1999 года (зав.кафедрой Дыгай Г.И.). В настоящее время музей включает 5 отделов, составленных из 13 типов, 21 класса и 135 видов животных. В его подготовке приняли участие сотрудники кафедры доценты Т.Г.Васильева, В.А.Романенко, О.Г.Пенькова, В.С.Храмцова, проф. С.В.Пыжьянов и зав.кабинетом В.А.Кашлова. Научная работа преподавателей кафедры идет в различных направлениях. Это и научно-методическая работа по совершенствованию профессиональной подготовки учители, и научные исследования зооценозов Прибайкалья. Участвуют в работе по грантам Пыжьянов С.В., Пенькова О.Г., Плешанова Г.И.. Ежегодно преподаватели участвуют в работе научных конференций различного уровня. За последние 5 лет кафедрой подготовлено и опубликовано более 50 научных статей, 7 методических рекомендаций, 1 учебное пособие (Пенькова О.Г. - "Уроки Байкала"), 1 авторская программа по биологии для средней школы (Дыгай Г.И.), совместно с кафедрой географии опубликован учебник "География Усть-Ордынского национального округа".

Кафедра ботаники - формировалась под непосредственным руководством заведующей кафедрой зоологии, доцента Веры Аркадьевны Шиняевой в период с 1962 по 1967 гг. В течение пяти лет "школу" В.А.Шиняевой прошли многие преподаватели, которые и составили основу официально созданной в 1967 г. кафедры ботаники. Некоторые из них до этого имели большой опыт работы в школе, например: В.А.Горбунова, Е.А.Судакова, Ю.В.Лузгина, Е.А.Нечаева, или работали в научных сельскохозяйственных учреждениях – Е.М.Высоких, З.П.Черных, Э.В.Москвина. Трудовой путь их на кафедре начинался с лаборанта или ассистента. Лишь двое из них к этому времени закончили аспирантуру при ИСХИ – Е.М.Высоких и Ю.В.Лузгина. Первым заведующим кафедрой ботаники был избран кандидат биологических наук доцент Венедикт Игнатьевич Бычков. В последующие годы кафедрой руководили доценты Л.И. Жучилин (1973 – 1975), Ю.В.Лузгина (1975 – 1980), Е.А.Судакова (1980 – 1990), В.А.Горбунова (1990 - 2000). С ростом естественно-географического факультета росла и кафедра ботаники, укреплялась ее материальная база, постепенно пополнялся преподавательский коллектив.

В разные годы по конкурсу были приняты кандидаты биологических наук, доценты Н.Б.Хворова, А.А.Емельяненко, ассистенты М.В.Талалаева (впоследствии кандидат биологических наук, доцент), Л.М.Пименова, Л.И.Ларионова. Творческий и научный потенциал кафедры рос очень быстро. Среди других кафедр института она считалось одной из самых высококвалифицированных. Через аспирантуру или соискательство защитили кандидатские диссертации: Е.М.Высоких (1966 г), Ю.В.Лузгина (1972 г), З.П.Черных и М.В.Талалаева (1975 г), В.А.Горбунова и Е.А.Нечаева (1976 г), Е.А.Судакова (1977 г) и Э.В.Москвина (1987 г). Темы их диссертационных работ различны. В одних можно найти ответы по биологии и агротехнике выращивания томатов, пшеницы, кормовых злаков и некоторых лекарственных растений, например таких как "золотой корень". В других работах изучаются декоративные свойства кустарников Прибайкалья с целью использования их в озеленении, или они посвящены изучению почвенной биоты, включающей актиномицеты, бактерии, грибы и водоросли. По методике преподавания биологии защитила диссертацию Е.А.Нечаева, став кандидатом педагогических наук. Она проработала 25 лет в институте и в 1987 г. ушла на заслуженный отдых. В этом же году на ее место была избрана старшим преподавателем Г.А.Жулева.

Численный состав кафедры ботаники на протяжении многих лет изменялся. В 1985 г. кафедра проводила в последний путь скоропостижно скончавшуюся в рассвете творческих сил доцента Д.А.Дульбинскую. При становлении кафедры зоологии и ботаники постепенно создавалась база для учебной и научной работы преподавателей и студентов. В кабинете ботаники собран учебный и справочный гербарий из более чем 10 тыс. листов. В нем есть отделы: cистематический, географический, геоботанический, хозяйственных растений, включая лекарственные, кормовые, декоративные, охраняемые, съедобные, а также ядовитые и сорные растения Кафедра ботаники большое внимание уделяет повышению эффективности учебно-воспитательного процесса. На методическом семинаре кафедры обсуждаются вопросы профессиональной направленности изучаемых дисциплин, активных методов обучения, межпредметных связей и др.

Наиболее важным направлением работы кафедры в последние годы являлось экологическое, которым пронизаны все сферы деятельности: учебная, воспитательная, научная, методическая, НИРС и УИРС. Накопленный материал обобщается и публикуется в виде методических рекомендаций в помощь студентам и учителям школ.

Кафедра экологии [Фотоальбом] была создана в 1997 году с целью подготовки учителей экологии и формирования у студентов всех факультетов Академии (до 2009 года -ИГПУ) естественнонаучного мировоззрения и нового экологического мышления. Под руководством первого заведующего кафедрой - профессора, доктора химических наук Алексея Алексеевича Потапова был собран сильный, профессиональный коллектив и, возможно, поэтому, первые трудности, связанные с этапом становления кафедры и новых дисциплин, были успешно преодолены - в большей мере за счет профессионализма и педагогического опыта первых ее сотрудников: профессора, доктора химических наук Ларисы Ивановны Копыловой, доктора биологических наук, профессора Сергея Владимировича Пыжьянова, кандидата биологических наук Татьяны Михайловны Быченко, кандидата физико-математических наук Раисы Тимофеевны Сотниковой. С момента организации кафедры шел непрерывный, профессиональный рост коллектива. В 1998 году успешно защитил докторскую диссертацию С.В. Пыжьянов. В этом же году была открыта аспирантура по специальности "Экология". В 1998 году на кафедру пришли новые специалисты из НИИ Биологии Иркутского государственного университета: кандидаты биологических наук Владимир Александрович Подковыров, Дмитрий Евгеньевич Гавриков. В аспирантуру была принята талантливая молодежь - Л.В. Ипатьева, Н.С. Горина, О.М. Пушмина, Т.В. Просвирнина и другие выпускники ИГПУ.

В 2000 году под руководством А.А. Потапова сотрудники кафедры разработали программу "Экологическое образование населения Приангарья", которая обсуждалась и корректировалась населением Байкальского региона. В 2005 г. сотрудники кафедры принимали участие в разработке Целевой программы Иркутской области по экологическому образованию. В 2000 году из Иркутского государственного университета на кафедру пришел кандидат биологических наук Алексей Александрович Приставка. В этом же году сотрудник кафедры В.А. Подковыров был избран деканом Естественно-географического факультета ПИ ИГУ. Доктор биологических наук, профессор С.В. Пыжьянов был избран заведующим кафедры биологии ИГПУ. В 2001 году на кафедре была лицензирована и открыта новая специальность - экология с присвоением более широкой, чем учитель экологии, квалификации - эколог. С этого же года кафедру возглавляет соросовский профессор Л.И. Копылова (до марта 2008 г.). С осени 2002 года в штат кафедры вошли высококвалифицированные специалисты, кандидаты биологических наук: Игорь Иннокентьевич Тупицын; Надежда Иннокентьевна Валеева; Константин Леонидович Кравченко. С 2004 по 2007 году на кафедре работала Пензина Татьяна Алексеевна. В этом же году прошла защита кандидатской диссертации Кравченко К.Л. В 2005 году защитил кандидатскую диссертацию Гавриков Д.Е.

За время существования кафедры ее сотрудниками подготовлены монографии, учебные и учебно-методические пособия и многое другое (полный список наших достижений см. в разделе История/Достижения) Сотрудники кафедры ведут большую научно-исследовательскую и просветительскую работу среди студентов ПИ ИГУ, школьников и учителей, методистов по экологии и т.д. Ежегодно они принимают участие в школьных, студенческих городских, областных, Всероссийских олимпиадах, научных и научно-практических конференциях, заключают творческие договора с различными организациями (полный список наших достижений см. в разделе История/Достижения - Сотрудничество).